Навчально-науковий медичний інститут був створений рішенням вченої ради Східноєвропейського національного університету імені Лесі Українки 29 серпня 2020 року на базі медико-біологічного факультету та кафедри фізичної терапії та ерготерапії факультету фізичної культури, спорту та здоров’я. 30 вересня 2021 року інститут перейменовано в медичний факультет.
Медичний факультет Волинського національного університету імені Лесі Українки провадить освітню діяльність із підготовки фахівців за освітнім ступенем «Магістр» за спеціальностями 222 Медицина, 226 «Фармація, промислова фармація», 227 Фізична терапія, ерготерапія.